بعد از پیروزی شکوهمند انقلاب اسلامی ایران و ضرورت ارتقای ارزشهای دینی و آگاهی های معنوی و مذهبی در مراکز آموزش عالی، ستاد انقلاب فرهنگی تشکیل شد و این ستاد در سال 1360 بعد از پایان تعطیلی دانشگاه ها به وزارت فرهنگ و آموزش عالی پیشنهاد کرد که به موازات دروس اختصاصی و پایه رشته های مختلف هر دانشگاه ۱۲ واحد را به نام واحد های معارف اسلامی برنامه ریزی نماید. در سال 1372 گروه معارف در دانشگاه ها شکل گرفت ولی اساتید این گروه ها حق التدریس بودند در دانشگاه علوم پزشکی ایران از سال 1376 گروه معارف زیر نظر معاونت آموزشی و با نظارت دفتر نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری آغاز بکار کرد.